A forma mais comum de se obter o biodiesel é pela reação química dos óleos vegetais com metanol ou etanol, na presença de um catalizador, em processo químico conhecido como transesterificação. Os produtos desta reação são a mistura de ésteres etílicos ou metílicos de ácidos graxos (biodiesel), que compõe o próprio biodiesel e glicerina, cujo maior constituinte é o glicerol.
Processo esterificação etílica/metílica

